會議強調，構建“黨政同責、一崗雙責”的生態環境保護管理體系，建立生態環境保護考核機制，是生態文明機制體制改革的重要任務，也是把生態環境保護責任擔當起來、落到實處的重要舉措。要突出“嚴”和“實”，認真抓好地方黨政領導生態環境保護責任制的落實，建立規范化的考核評價機制，客觀科學評價各地生態環保目標責任書落實成效。要堅持目標導向、問題導向、結果導向、責任導向，突出重點領域重點任務，突出公眾生態環境質量獲得感，注重考核評價結果運用，著力構建落實生態環境保護責任的長效機制。要堅持綠色發展，正確處理經濟發展和生態環境保護的關系，積極創新生態文明建設體制機制，讓良好的生態環境成為人民生活的增長點。會議研究了《福建省地方黨政領導生態環境保護目標責任書考核辦法》，決定提請省委常委會議研究。
會議同時指出，抓好畜禽養殖廢棄物資源化利用，是貫徹落實《國家生態文明試驗區（福建）實施方案》的重要舉措之一，也是重大的民生工程。研究通過《福建省加快推進畜禽養殖廢棄物資源化利用實施方案》，各級政府各有關部門要堅持政府支持、企業主體、市場化運作的方針，堅持源頭減量、過程控制、末端利用的治理路徑，落實畜禽規模養殖環評制度，嚴格畜禽養殖準入門檻；強化屬地政府管理責任、部門監管責任和規模養殖場主體責任，將畜禽養殖廢棄物資源化利用納入各級政府績效評價考核體系；建立健全畜禽養殖廢棄物資源化利用市場機制，形成收集、存儲、運輸、處理和綜合利用全產業鏈，探索建立受益者付費機制，保障第三方處理企業和社會化服務組織合理收益。到2020年，全省畜禽糞污綜合利用率達90%以上，規模養殖場糞污處理設施裝備配套率達到95%以上，基本解決畜禽規模養殖場糞污處理和資源化問題，構建種養結合、農牧循環的可持續發展新格局。
會議還研究了環境保護稅福建省適用稅額和應稅污染物項目數的議案，決定提請省人大常委會審議。會議指出，要推動環境保護稅與現行排污費收費制度平穩轉換，積極發揮稅收在控制和減少污染物排放、保護和改善生態環境方面的重要作用。
